Il 30 ottobre dello stesso anno venne di nuovo arrestato, perché accusato di correità con il gruppo giellista Bauer-Rossi-Ceva. Prosciolto in istruttoria, non ottenne la libertà, ma quale «pertinace avversario del regime», fu mandato al confino per cinque anni. 
Tornato a Milano all’inizio del 1933, riprese gli studi di economia e collaborò col «Giornale degli economisti e rivista di statistica» di Giorgio Mortara, ed entrò a far parte, nel dicembre 1934, dell’Ufficio studi della Edison. Per tutto questo periodo svolse un lavoro di collegamento tra i gruppi clandestini dell’Italia settentrionale e pose le basi di quella che divenne la struttura portante della lotta armata per la liberazione del Paese. Nel 1942 aderì al Partito d’Azione e nel settembre del 1943 al Comitato militare dei partiti antifascisti (che si riuniva nei sotterranei della Edison). Assunto il nome di battaglia “Maurizio”, dal nome dell’antico colle che domina la sua città natale -Pinerolo- e sul quale andava da bambino, Parri fu costantemente al centro dell’attività resistenziale: dall’8 settembre 1943 in poi, formò e coordinò i primi nuclei partigiani del Nord e sviluppò il centro clandestino di Milano. 
In seguito alla trasformazione del Comitato militare in Comando generale (giugno 1944), Parri e Luigi Longo assunsero il ruolo di vice comandanti e furono incaricati della responsabilità di coordinare le formazioni Giustizia e libertà (GL) e Garibaldi.
Nel dicembre 1944 fu inviato in missione al Sud, presso gli alleati, per ottenere il primo riconoscimento ufficiale del Corpo volontari della libertà – CVL; ma di ritorno, il 2 gennaio 1945, Parri venne catturato dalla Gestapo, interrogato nei locali dell’Albergo Regina e poi trasferito nel carcere di Verona. Rimesso in libertà nel mese di marzo, in seguito all’intervento alleato, intraprese con il generale Cadorna una nuova missione al Sud, per impostare la fase insurrezionale. Riuscì a rientrare a Milano il 25 aprile 1945, a insurrezione già iniziata.
Nell’immediato dopoguerra Parri fu invitato dai partiti antifascisti a presiedere il primo governo dell’Italia liberata; ma il Governo Parri cadde solo pochi mesi dopo, nel novembre del 1945 e, con la crisi del Partito d’azione, decise di fondare il Movimento della democrazia repubblicana (1946), col quale fu eletto deputato all’Assemblea costituente. 
Nel 1946 fondò l’Istituto di studi economici, mentre nel 1949 l’Istituto nazionale per la storia del movimento di liberazione in Italia – INSMLI e, nello stesso anno, divenne presidente della Federazione italiana associazioni partigiane – FIAP. 
Dal 1959 lavorò alla costituzione di un Consiglio federativo della Resistenza e nel 1960 propose in Parlamento lo scioglimento del Movimento sociale italiano – MSI.
Il 2 marzo 1963 venne nominato senatore a vita e, nello stesso mese, fondò il periodico politico «L’Astrolabio» insieme ad Ernesto Rossi. 
Nel corso degli anni Settanta ridusse progressivamente sia l’attività politica che quella giornalistica. 
Morì a Roma l’8 dicembre 1981.

Annalisa Bertani