Come molti altri colleghi, la Thomas prese parte agli scioperi del marzo 1943 e, per questo motivo, venne accusata di essere una “sabotatrice ed esponente della propaganda antifascista tra le compagne di lavoro”. Alle Officine Borletti, infatti, lo sciopero iniziò con slogan e urla di protesta proprio dal reparto spoletteria nel quale lavorava la Thomas. Il 29 marzo 1943 venne licenziata e fatta arrestare e trascorse il mese di aprile di quell’anno a San Vittore. Fu liberata solo nel mese di maggio del 1943.
Dopo l’Armistizio restò in contatto con il mondo operaio antifascista e, successivamente, fu inserita nel Comitato lombardo del Corpo Volontari della Libertà – CVL.
La Thomas partecipò anche ai grandi scioperi del marzo 1944 e, anche se non partecipò come operaia della Borletti, venne comunque arrestata. 
Per ottenere il suo rilascio e quello delle donne e delle operaie che avevano aderito allo sciopero della Borletti, venne organizzato un altro sciopero di protesta: molte furono liberate, mentre la Thomas fu trattenuta in carcere. 
Dato che gli arresti conseguenti agli scioperi furono innumerevoli, il carcere di S. Vittore era così pieno che inizialmente la Thomas e le operaie della Borletti furono portate alla caserma San Fedele, poi di nuovo a San Vittore e, infine, al carcere di Brescia; dove iniziò il viaggio che portò la Thomas e altre donne nei campi di concentramento. 
Come ricorda Enrichetta Bartesaghi, operaia al reparto spolette della Borletti: “Con un camion siamo andate alla stazione e lì c’era un treno pieno di vacche e noi siamo salite dopo che avevano fatto scendere le vacche. Non siamo andate subito a Mauthausen, ma prima siamo andate a Innsbruck. Dopo siamo andate a Mauthausen. Ci hanno messe in una cella, ci hanno portato via tutto e ci hanno tagliato i capelli e ci hanno portato via i vestiti e non potevamo dire niente perché ci bastonavano […] Ci hanno messo un vestito rigato e ci hanno messo in una cella”. Da Mauthausen, furono portate ad Auschwitz e alla Thomas fu assegnato e tatuato il numero 78985 sull’avambraccio sinistro.
Verso la fine del 1944, con l’avanzata dei carri armati sovietici da est, il campo di Auschwitz fu evacuato e la Thomas venne trasferita a Bergen Belsen, dove, secondo la testimonianza di un’altra sua compagna della Borletti – Teresa Pellicciari – “Carlotta morì di tifo il 10 aprile del 1945”.

Oltre alla pietra d’inciampo posta di fronte a quella che fu la sua abitazione, il suo nome fu iscritto nella lapide collettiva che venne collocata in piazza Tirana a Milano e in quella dei lavoratori e delle lavoratrici della Borletti, che si trovava in via Washington 60 a Milano, dove c’era lo stabilimento.

Annalisa Bertani